Epidemiología molecular del VIH-1

Descripción

Resumen

El Laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH-1, adscrito al servicio de Microbiología del Hospital Ramón y Cajal, es un grupo de investigación dentro del Instituto Ramón y Cajal de Investigación Sanitaria (IRYCIS). Está liderado por la Dra. África Holguín, Investigadora del Sistema Nacional de Salud con categoría A. Realizó su doctorado en el Centro de Biología Molecular “Severo Ochoa” de Madrid, complementando su formación en Harvard Medical School (Boston) y en Frankfurt. Desde 1997 ha realizado su investigación en el campo de la variabilidad genética de virus ARN, incluido el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH). Actualmente es autora de más de 75 publicaciones en revistas de prestigio internacionales, con un índice H de 20. Con amplia experiencia docente en prácticas universitarias y de masteres, ha sido ponente invitada de numerosos seminarios científicos y charlas en distintos masteres, cursos especializados y de doctorado. Ha dirigido varias Tesis Doctorales y numerosas Tesinas, proyectos Fin de Carrera y proyectos Fin de Master en VIH y Microbiología. Ha supervisado la formación científico-técnica y el trabajo de investigación del personal de su línea de investigación, formando también a personal técnico a nivel internacional.

Actualmente el grupo participa en proyectos de investigación a nivel nacional e internacional con financiación pública y privada, tanto en población adulta como pediátrica infectada por VIH de España y de otros países. EL grupo colabora a nivel nacional con la Red en SIDA (Cohorte CoRIS), con el BioBanco-VIH, con el Centro Nacional de Medicina Tropical, con la Cohorte pediátrica de niños y adolescentes infectados por VIH de la Comunidad de Madrid, con el Centro Sanitario Sandoval y con el Servicio de Infecciosas y Sección de Medicina Tropical del Hospital Ramón y Cajal de Madrid. Asimismo, el grupo está integrado dentro del Grupo 33 del Centro de Investigación Biomédica en Red (CIBER) de Epidemiología y Salud Pública (CIBERESP). Colabora con grupos de investigación internacionales y participa en proyectos de Cooperación Internacional en el campo del VIH respaldados por el Plan Nacional de SIDA en el marco del Proyecto Esther, con el apoyo de la Agencia Española para la Cooperación y Desarrollo (AECID), del Fondo Global, colaborando directamente con Ministerios de Sanidad de otros países.

Equipamiento/ Know-How del grupo relevante

El Laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH-1 se remodeló totalmente en diciembre de 2010. Dispone de una habitación independiente libre de material genético para la preparación de reactivos (zona de preamplificación), separada de una zona para la amplificación de material genético viral por PCR y para manejo de los producto genéticos virales amplificados (zona de PCR y postamplificación), zona para realizar electroforesis y visualizar los productos amplificados por PCR (zona de electroforesis), y una zona de despacho con varios puestos de trabajo. El laboratorio está totalmente equipado para realizar las técnicas de biología molecular requeridas en los servicios ofertados y todos los equipos tienen menos de 4 años. Cuenta con instalación eléctrica totalmente renovada, con más de 60 tomas de electricidad para los distintos aparatos distribuidos en 35 m2. Tiene neveras y congeladores suficientes para almacenar a 4ºC, -20ºC y –80ºC todo el material y reactivos requeridos, así como las muestras a procesar. Cuenta con dos cabinas con UVA diferentes para la preparación de reactivos (zona de amplificación) y para preparar las reacciones de la amplificación de material genético por PCR (zona de postamplificación), respectivamente, así como varios termocicladores, varios equipos de electroforesis para visualización de material amplificado y con un sistema de análisis de imágenes centralizado en el IRYCIS. La zona de preamplificación y de postamplificación cuenta con equipamiento independiente y exclusivo (cabinas con UVA, pipetas automáticas, congelador de -20ºC, vortex, microcentrífuga, etc.), para evitar contaminaciones de ácidos nucléicos. Para el manejo de plasmas y muestras infectadas por VIH-1, el laboratorio emplea la infraestructura de la Unidad Central de Apoyo (UCA) a la investigación de Microbiología Molecular, situada en la planta -1 Izda del mismo hospital, en especial la cabina de seguridad biológica tipo II-A y sistemas de extracción semi-automático de material genético. El laboratorio de Epidemiología Molecular ha sido diseñado siguiendo las directrices de la OMS para laboratorios similares y para garantizar la máxima calidad de los procesos como garantía de excelencia del trabajo que en el laboratorio se realiza.

Aplicaciones

Las principales áreas de trabajo del grupo son la variabilidad genética del VIH y caracterización de variantes, la identificación de resistencias a antirretrovirales y el estudio de las repercusiones epidemiológicas, clínicas, diagnósticas y terapéuticas de las infecciones por subtipos no-B y recombinantes del VIH-1. Otro área de interés es la optimización de métodos de monitorización de la infección por VIH más baratos y sencillos para su implantación en países con bajos recursos.

Ventajas

El Laboratorio de Epidemiología Molecular está en proceso de acreditación como laboratorio especializado en VIH de referencia de la Organización Mundial de la Salud (OMS) para la detección de resistencias en el VIH empleando distintos tipos de muestras (incluyendo sangre seca en papel de filtro: Dried blood spots o DBS) dentro de la Red RESNET de OMS.

Su solicitud cuenta con el apoyo por escrito de la Secretaría del Plan Nacional de SIDA español. Las primeras noticias que tenemos al respecto es que la propuesta de solicitud ha sido muy bien valorada por el departamento correspondiente de la OMS en Ginebra. Sin embargo, estamos a la espera de recibir un panel de muestras antes de final de año para evaluar controles de calidad antes de concluir la acreditación. Por otra parte, con toda la documentación generada en la solicitud, estamos implantando sistemas de calidad en toda la investigación e innovación que realiza el grupo.

Todos los servicios ofertados por el laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH-1 incluyen:

  • Precios muy competitivos y máxima calidad en los procedimientos.
  • Trato personalizado y asesoría online para consultas o resolución de dudas por personal acreditado.
  • Experimentos realizados en un laboratorio especializado con gran experiencia y rigor científico acreditado y en proceso de acreditación por la OMS. Tratamiento individualizado de cada muestra.

El laboratorio trabaja en proyectos nacionales de investigación en cooperación internacional.

Servicios ofertados

- Detección e interpretación de resistencias genéticas a fármacos antirretrovirales en cepas del VIH-1 de cualquier subtipo o recombinante a partir de muestras de:

o Sangre completa

o Sangre seca recogida en papel de filtro (DBS)

o Plasma o suero

o Células o tejidos infectados

 - Identificación de la variante (subtipo o recombinante) del VIH-1 por análisis filogenético.

 - Servicios de formación y asesoría especializada en el campo de VIH-SIDA:

o Elaboración de Planes de Formación (teóricos y prácticos) en el campo del VIH adecuados a las necesidades y al perfil de los clientes en ámbito nacional e internacional.

o Posibilidad de formación práctica en técnicas de biología molecular en el campo del VIH en el laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH del Instituto de Investigación IRYCIS.

o Servicio de consultoría en la elaboración de proyectos de investigación y de artículos científicos en el campo de la variabilidad genética del VIH y resistencia a antirretrovirales frente al VIH.

o Servicio de consultoría en el diseño y puesta en marcha de laboratorios de biología molecular y cultivos virales.